芙蓉洞最有价值的，正是在特殊背景下形成的类型极为丰富、形态极为精美的洞穴沉积。它几乎包括了已经过科学命名的所有喀斯特洞穴沉积类型。

 

喀斯特洞穴沉积都离不开水，一类和重力作用的水有关，例如：形成于滴水的石钟乳、石笋、石柱、鹅管等；由洞壁和洞顶流水形成的石旗、石幕、石瀑、石幔等；洞底流水会形成石田、石珍珠等；洞中飞溅的水，会形成石葡萄、石瘤等。另一类和非重力作用的水有关，例如在洞壁或洞穴沉积表面，因毛细管作用或自由结晶作用形成的晶霜、晶花、石花等。

 

芙蓉洞的洞穴沉积不仅种类极其丰富，而且有许多世所罕见的精品。其中，池水沉积堪称精华之一。例如洞中的“珊瑚瑶池”、“犬牙晶花池”、“贵妃浴池”等，在清澈透底的池水中，碳酸钙析出成为十分完美的方解石或文石晶体，它们或呈葡萄状、糖粒状，或呈犬牙状、梳状，而且不同形态的晶丛、晶簇层层叠叠，厚可达50厘米左右，晶莹剔透，玉洁冰清，让人如入梦中瑶池。

 

在芙蓉洞的东端，有一个向南延伸的支洞，当专家们探查这个支洞时，既感到震惊，也不忍心踏入。因为在这个被命名为“石膏花支洞”的洞穴中，晶霜、晶花、石花几乎遍及每一块岩石表面，投足下脚都会不可避免地让它们受到损伤，特别是那些洁白如玉而又十分脆弱的叶片状、豆芽状、丝缕状、花瓣状的石膏花和卷曲石，一旦不小心将它们碰断碰碎，其代价绝不亚于一件国宝级的文物被损毁。例如，石膏花支洞中发现的鹿角状卷曲石的枝长可达到57厘米，为世界已知最长者。因此，当专家们考察了石膏花支洞，并仔细拍照以后，建议把这个洞封存起来，现在这个支洞也未纳入开发计划。虽然游客也许永远没有机会走进这个支洞，但毕竟有机会使这些稀世珍宝能够与世长存。

 

石幕、石瀑、石笋、石钟乳这类景观，常见于许多喀斯特洞穴中。但芙蓉洞的这类景观却让人难忘。被誉为洞中一绝的“巨幕飞瀑”，是芙蓉洞石幕景观的典型代表，它那种流畅如水、细腻精致的线条，使人想起古希腊的雕塑，而这种风格的石瀑正是芙蓉洞的一道“招牌菜”。被称为“霸王巨盔”的景点，是一个曾悬挂于洞顶的直径10米，长15米的巨型石钟乳崩落的结果，它把下方的一个直径7.8米，高6米的石笋砸为三截，二者均为我国已知体量最大的石钟乳和石笋。这个崩落的石钟乳上面已生长了新的石笋，据对这些新石笋的同位素年龄测定，可知巨型石钟乳崩落的时间大约在10万年前。

 

 

芙蓉洞全长2846米，由于受两组裂隙控制，洞穴平面上呈东北偏东、西北偏北两个走向的折线式延伸。从发现芙蓉洞之初，人们就一直在寻找芙蓉洞的另一个出口，从旅游开发的角度，也希望另有一个洞口，以避免游客走回头路。但芙蓉洞的其他出口始终没有找到。据笔者实地观察，芙蓉洞之所以被称为“气洞”，是因为洞内空气湿度常年高于洞外，且洞内温度十分恒定，由于洞内空气只能通过洞口与洞外进行交换，所以在洞外湿度偏低、气温偏低的情况下，出自洞内的空气因水汽凝结作用极易在洞口形成大团气雾。这说明芙蓉洞内的空气对流十分微弱。这种高湿度和静风的环境，使游客在进洞之前都被告知要尽量减少身上所穿衣物，尤其是在冬季，不然在洞内行走很容易大汗淋漓。这也反映出芙蓉洞可能的确只有一个洞口，即使还有可能存在其他出口，其通道也应十分复杂和较为闭塞。

 

虽然没有发现芙蓉洞的其他出口，但为了形成一个环形的游览通道，人们还是赶在1995年5月1日芙蓉洞正式开放以前，凿通了一条由芙蓉洞中部通往芙蓉江边的隧洞，作为游览路线的出口。这个人工洞口打通以后，人们很快发现，不仅洞内的气流、湿度和温度有了明显变化，而且有的洞穴沉积景观也出现发黄变干的迹象。为了最大限度地减少对洞内景观的不利影响，人们在这个人工洞口构筑了厚实的洞门，除了游客出洞时短暂开启以外，平时严格关闭。

 

来自中外的洞穴探险队，不仅对芙蓉洞内那些精妙绝伦的洞穴沉积着迷，也对芙蓉洞及其附近的幽深曲折的洞穴系统感兴趣。这些探险家意想不到的是，经过1994年至2001年的探查，在芙蓉洞附近的天星乡境内，竟发现了世界上罕见的喀斯特竖井群。在约20平方公里的范围内，至少散布着50个大小不一的竖井，深度均超过100米，其中，汽坑洞的深度为920米，排名居中国乃至亚洲第一。